Publications of Andreas Brune

Radek, R.; Hassler, J.; Meuser, K.; Ahmad, H.; Fromm, T.; Strüder-Kypke, M.; Sillam-Dussès, D.; Synek, J.; Šobotník, J.; Herve, V. et al.; Brune, A.: Phylogeny, morphology, and ultrastructure of sessilid peritrich ciliates in termite guts, Termitophrya africana and Doliophrys denislynni gen. nov., sp. nov. European Journal of Protistology 99, 126140 (2025)

Kästle Silva, J. M.; Herve, V.; Mies, U. S.; Platt, K.; Brune, A.: A novel lineage of endosymbiotic Actinomycetales genome reduction and acquisition of new functions in Bifidobacteriaceae associated with termite gut flagellates. Environmental Microbiology 27 (1), e70010 (2025)

Moreira Salgado, J. F.; Herve, V.; Vera, M. A. G.; Tokuda, G.; Brune, A.: Unveiling lignocellulolytic potential: a genomic exploration of bacterial lineages within the termite gut. Microbiome 12 (1), 201 (2024)

Protasov, E.; Reeh, H.; Liu, P.; Poehlein, A.; Platt, K.; Heimerl, T.; Herve, V.; Daniel, R.; Brune, A.: Genome reduction in novel, obligately methyl-reducing Methanosarcinales isolated from arthropod guts (Methanolapillus gen. nov. and Methanimicrococcus). FEMS Microbiology Ecology 100 (9), fiae111 (2024)

Mies, U. S.; Hervé, V.; Kropp, T.; Platt, K.; David, S.-D.; Jan, Š.; Brune, A.: Genome reduction and horizontal gene transfer in the evolution of Endomicrobia—rise and fall of an intracellular symbiosis with termite gut flagellates. mBio 15 (6), e00826-24 (2024)

Nweze, J. E.; Šustr, V.; Brune, A.; Angel, R.: Functional similarity, despite taxonomical divergence in the millipede gut microbiota, points to a common trophic strategy. Microbiome 12, 16 (2024)

Arora, J.; Buček, A.; Hellemans, S.; Beránková, T.; Arias, J. R.; Fisher, B. L.; Clitheroe, C.; Brune, A.; Kinjo, Y.; Šobotník, J. et al.; Bourguignon, T.: Evidence of cospeciation between termites and their gut bacteria on a geological time scale. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences 290 (2001), 20230619 (2023)

Pavlopoulos, G. A.; Baltoumas, F. A.; Liu, S.; Selvitopi, O.; Camargo, A. P.; Nayfach, S.; Azad, A.; Roux, S.; Call, L.; Ivanova, N. N. et al.; Chen, I. M.; Paez-Espino, D.; Karatzas, E.; Acinas, S. G.; Ahlgren, N.; Attwood, G.; Baldrian, P.; Berry, T.; Bhatnagar, J. M.; Bhaya, D.; Bidle, K. D.; Blanchard, J. L.; Boyd, E. S.; Bowen, J. L.; Bowman, J.; Brawley, S. H.; Brodie, E. L.; Brune, A.; Bryant, D. A.; Buchan, A.; Cadillo-Quiroz, H.; Campbell, B. J.; Cavicchioli, R.; Chuckran, P. F.; Coleman, M.; Crowe, S.; Colman, D. R.; Currie, C. R.; Dangl, J.; Delherbe, N.; Denef, V. J.; Dijkstra, P.; Distel, D. D.; Eloe-Fadrosh, E.; Fisher, K.; Francis, C.; Garoutte, A.; Gaudin, A.; Gerwick, L.; Godoy-Vitorino, F.; Guerra, P.; Guo, J.; Habteselassie, M. Y.; Hallam, S. J.; Hatzenpichler, R.; Hentschel, U.; Hess, M.; Hirsch, A. M.; Hug, L. A.; Hultman, J.; Hunt, D. E.; Huntemann, M.; Inskeep, W. P.; James, T. Y.; Jansson, J.; Johnston, E. R.; Kalyuzhnaya, M.; Kelly, C. N.; Kelly, R. M.; Klassen, J. L.; Nüsslein, K.; Kostka, J. E.; Lindow, S.; Lilleskov, E.; Lynes, M.; Mackelprang, R.; Martin, F. M.; Mason, O. U.; McKay, R. M.; McMahon, K.; Mead, D. A.; Medina, M.; Meredith, L. K.; Mock, T.; Mohn, W. W.; Moran, M. A.; Murray, A.; Neufeld, J. D.; Neumann, R.; Norton, J. M.; Partida-Martinez, L. P.; Pietrasiak, N.; Pelletier, D.; Reddy, T. B. K.; Reese, B. K.; Reichart, N. J.; Reiss, R.; Saito, M. A.; Schachtman, D. P.; Seshadri, R.; Shade, A.; Sherman, D.; Simister, R.; Simon, H.; Stegen, J.; Stepanauskas, R.; Sullivan, M.; Sumner, D. Y.; Teeling, H.; Thamatrakoln, K.; Treseder, K.; Tringe, S.; Vaishampayan, P.; Valentine, D. L.; Waldo, N. B.; Waldrop, M. P.; Walsh, D. A.; Ward, D. M.; Wilkins, M.; Whitman, T.; Woolet, J.; Woyke, T.; Iliopoulos, I.; Konstantinidis, K.; Tiedje, J. M.; Pett-Ridge, J.; Baker, D.; Visel, A.; Ouzounis, C. A.; Ovchinnikov, S.; Buluç, A.; Kyrpides, N. C.; Consortium, N. M. P. F.: Unraveling the functional dark matter through global metagenomics. Nature 622 (7983), pp. 594 - 602 (2023)

Protasov, E.; Nonoh, J. O.; Kästle Silva, J. M.; Mies, U. S.; Herve, V.; Dietrich, C.; Lang, K.; Mikulski, L.; Platt, K.; Poehlein, A. et al.; Köhler-Ramm, T.; Miambi, E.; Boga, H. I.; Feldewert, C.; Ngugi, D. K.; Plarre, R.; Sillam-Dussès, D.; Šobotník, J.; Daniel, R.; Brune, A.: Diversity and taxonomic revision of methanogens and other archaea in the intestinal tract of terrestrial arthropods. Frontiers in Microbiology 14, 1281628 (2023)

Radek, R.; Platt, K.; Oztas, D.; Sobotnik, J.; Sillam-Dusses, D.; Hanus, R.; Brune, A.: New insights into the coevolutionary history of termites and their gut flagellates: Description of Retractinympha glossotermitis gen. nov. sp. nov. (Retractinymphidae fam. nov.). Frontiers in Ecology and Evolution 11, 1111484 (2023)

Treitli, S. C.; Hanousková, P.; Beneš, V.; Brune, A.; Čepička, I.; Hampl, V.: Hydrogenotrophic methanogenesis is the key process in the obligately syntrophic consortium of the anaerobic ameba Pelomyxa schiedti. The ISME Journal 17 (11), pp. 1884 - 1894 (2023)

Song, Y.; Pfeiffer, F.; Radek, R.; Hearne, C.; Hervé, V.; Brune, A.: Comparative analysis of Brucepastera parasyntrophica gen. nov., sp. nov. and Teretinema zuelzerae gen. nov., comb. nov. (Treponemataceae) reveals the importance of interspecies hydrogen transfer in the energy metabolism of spirochetes. Applied and Environmental Microbiology 88 (14), e0050322 (2022)

Brune, A.; Song, Y.; Oren, A.; Paster, B. J.: A new family for 'termite gut treponemes': description of Breznakiellaceae fam. nov., Gracilinema caldarium gen. nov., comb. nov., Leadbettera azotonutricia gen. nov., comb. nov., Helmutkoenigia isoptericolens gen. nov., comb. nov., and Zuelzera stenostrepta gen. nov., comb. nov., and proposal of Rectinemataceae fam. nov. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 72 (5), 005439 (2022)

Arora, J.; Kinjo, Y.; Sobotnik, J.; Bucek, A.; Clitheroe, C.; Stiblik, P.; Roisin, Y.; Zifcakova, L.; Park, Y. C.; Kim, K. Y. et al.; Sillam-Dusses, D.; Herve, V.; Lo, N.; Tokuda, G.; Brune, A.; Bourguignon, T.: The functional evolution of termite gut microbiota. Microbiome 10 (1), 78 (2022)

Loh, H. Q.; Herve, V.; Brune, A.: Metabolic potential for reductive acetogenesis and a novel energy-converting [NiFe] hydrogenase in Bathyarchaeia from termite guts - A genome-centric analysis. Frontiers in Microbiology 11, 635786 (2021)

Strassert, J. F. H.; Wurzbacher, C.; Herve, V.; Antany, T.; Brune, A.; Radek, R.: Long rDNA amplicon sequencing of insect-infecting nephridiophagids reveals their affiliation to the Chytridiomycota and a potential to switch between hosts. Scientific Reports 11 (1), 396 (2021)

Horvathova, T.; Sustr, V.; Chronakova, A.; Semanova, S.; Lang, K.; Dietrich, C.; Hubacek, T.; Ardestani, M. M.; Lara, A. C.; Brune, A. et al.; Simek, M.: Methanogenesis in the digestive tracts of the tropical millipedes Archispirostreptus gigas (Diplopoda, Spirostreptidae) and Epibolus pulchripes (Diplopoda, Pachybolidae). Applied and Environmental Microbiology 87 (15), e00614-21 (2021)

Nayfach, S.; Roux, S.; Seshadri, R.; Udwary, D.; Varghese, N.; Schulz, F.; Wu, D.; Paez-Espino, D.; Chen, I. M.; Huntemann, M. et al.; Palaniappan, K.; Ladau, J.; Mukherjee, S.; Reddy, T. B. K.; Nielsen, T.; Kirton, E.; Faria, J. P.; Edirisinghe, J. N.; Henry, C. S.; Jungbluth, S. P.; Chivian, D.; Dehal, P.; Wood-Charlson, E. M.; Arkin, A. P.; Tringe, S. G.; Visel, A.; Abreu, H.; Acinas, S. G.; Allen, E.; Allen, M. A.; Alteio, L. V.; Andersen, G.; Anesio, A. M.; Attwood, G.; Avila-Magaña, V.; Badis, Y.; Bailey, J.; Baker, B.; Baldrian, P.; Barton, H. A.; Beck, D. A. C.; Becraft, E. D.; Beller, H. R.; Beman, J. M.; Bernier-Latmani, R.; Berry, T. D.; Bertagnolli, A.; Bertilsson, S.; Bhatnagar, J. M.; Bird, J. T.; Blanchard, J. L.; Blumer-Schuette, S. E.; Bohannan, B.; Borton, M. A.; Brady, A.; Brawley, S. H.; Brodie, J.; Brown, S.; Brum, J. R.; Brune, A.; Bryant, D. A.; Buchan, A.; Buckley, D. H.; Buongiorno, J.; Cadillo-Quiroz, H.; Caffrey, S. M.; Campbell, A. N.; Campbell, B.; Carr, S.; Carroll, J. L.; Cary, S. C.; Cates, A. M.; Cattolico, R. A.; Cavicchioli, R.; Chistoserdova, L.; Coleman, M. L.; Constant, P.; Conway, J. M.; Mac Cormack, W. P.; Crowe, S.; Crump, B.; Currie, C.; Daly, R.; DeAngelis, K. M.; Denef, V.; Denman, S. E.; Desta, A.; Dionisi, H.; Dodsworth, J.; Dombrowski, N.; Donohue, T.; Dopson, M.; Driscoll, T.; Dunfield, P.; Dupont, C. L.; Dynarski, K. A.; Edgcomb, V.; Edwards, E. A.; Elshahed, M. S.; Figueroa, I.; Flood, B.; Fortney, N.; Fortunato, C. S.; Francis, C.; Gachon, C. M. M.; Garcia, S. L.; Gazitua, M. C.; Gentry, T.; Gerwick, L.; Gharechahi, J.; Girguis, P.; Gladden, J.; Gradoville, M.; Grasby, S. E.; Gravuer, K.; Grettenberger, C. L.; Gruninger, R. J.; Guo, J.; Habteselassie, M. Y.; Hallam, S. J.; Hatzenpichler, R.; Hausmann, B.; Hazen, T. C.; Hedlund, B.; Henny, C.; Herfort, L.; Hernandez, M.; Hershey, O. S.; Hess, M.; Hollister, E. B.; Hug, L. A.; Hunt, D.; Jansson, J.; Jarett, J.; Kadnikov, V. V.; Kelly, C.; Kelly, R.; Kelly, W.; Kerfeld, C. A.; Kimbrel, J.; Klassen, J. L.; Konstantinidis, K. T.; Lee, L. L.; Li, W. J.; Loder, A. J.; Loy, A.; Lozada, M.; MacGregor, B.; Magnabosco, C.; Maria da Silva, A.; McKay, R. M.; McMahon, K.; McSweeney, C. S.; Medina, M.; Meredith, L.; Mizzi, J.; Mock, T.; Momper, L.; Moran, M. A.; Morgan-Lang, C.; Moser, D.; Muyzer, G.; Myrold, D.; Nash, M.; Nesbø, C. L.; Neumann, A. P.; Neumann, R. B.; Noguera, D.; Northen, T.; Norton, J.; Nowinski, B.; Nüsslein, K.; O’Malley, M. A.; Oliveira, R. S.; Maia de Oliveira, V.; Onstott, T.; Osvatic, J.; Ouyang, Y.; Pachiadaki, M.; Parnell, J.; Partida-Martinez, L. P.; Peay, K. G.; Pelletier, D.; Peng, X.; Pester, M.; Pett-Ridge, J.; Peura, S.; Pjevac, P.; Plominsky, A. M.; Poehlein, A.; Pope, P. B.; Ravin, N.; Redmond, M. C.; Reiss, R.; Rich, V.; Rinke, C.; Rodrigues, J. L. M.; Rodriguez-Reillo, W.; Rossmassler, K.; Sackett, J.; Salekdeh, G. H.; Saleska, S.; Scarborough, M.; Schachtman, D.; Schadt, C. W.; Schrenk, M.; Sczyrba, A.; Sengupta, A.; Setubal, J. C.; Shade, A.; Sharp, C.; Sherman, D. H.; Shubenkova, O. V.; Sierra-Garcia, I. N.; Simister, R.; Simon, H.; Sjöling, S.; Slonczewski, J.; Correa de Souza, R. S.; Spear, J. R.; Stegen, J. C.; Stepanauskas, R.; Stewart, F.; Suen, G.; Sullivan, M.; Sumner, D.; Swan, B. K.; Swingley, W.; Tarn, J.; Taylor, G. T.; Teeling, H.; Tekere, M.; Teske, A.; Thomas, T.; Thrash, C.; Tiedje, J.; Ting, C. S.; Tully, B.; Tyson, G.; Ulloa, O.; Valentine, D. L.; Van Goethem, M. W.; VanderGheynst, J.; Verbeke, T. J.; Vollmers, J.; Vuillemin, A.; Waldo, N. B.; Walsh, D. A.; Weimer, B. C.; Whitman, T.; van der Wielen, P.; Wilkins, M.; Williams, T. J.; Woodcroft, B.; Woolet, J.; Wrighton, K.; Ye, J.; Young, E. B.; Youssef, N. H.; Yu, F. B.; Zemskaya, T. I.; Ziels, R.; Woyke, T.; Mouncey, N. J.; Ivanova, N. N.; Kyrpides, N. C.; Eloe-Fadrosh, E. A.; Consortium, I. M. D.: A genomic catalog of Earth’s microbiomes. Nature Biotechnology 39 (4), pp. 499 - 509 (2021)

Song, Y.; Herve, V.; Radek, R.; Pfeiffer, F.; Zheng, H.; Brune, A.: Characterization and phylogenomic analysis of Breznakiella homolactica gen. nov. sp. nov. indicates that termite gut treponemes evolved from non-acetogenic spirochetes in cockroaches. Environmental Microbiology 23 (8), pp. 4228 - 4245 (2021)

Feldewert, C.; Lang, K.; Brune, A.: The hydrogen threshold of obligately methyl-reducing methanogens. FEMS MICROBIOLOGY LETTERS 367 (17), fnaa137 (2020)